Większość gier w Commodore 64 grało się przy użyciu joystick'a, w tym komputerze można było zamontować 2 joystick'i lub na miejsce jednego z nich myszkę, dostępne też były gamepad'y. Te urządzenia sterujące już nie podłączymy do naszego PC, jednak możemy zagrać przy użyciu joystick'ów przeznaczonych do komputerów PC, emulator CSS64 umożliwia nam to.
Aby skonfigurować sterowanie tak jak nam to odpowiada z menu emulatora CCS64 wybieramy Options i następnie Input lub używamy klawiszy skrótu ALT+I. Tu znajdują wszelkie ustawienia dotyczące sterowania:
Control Port 1 - służ do ustawienia, jakiego typu urządzenie sterujące po stronie C64 ma być emulowane, najczęściej jest to opcja Joystick.
Mode - opcja ta ustawia, czym w naszym PC będziemy sterować, emulowanym urządzeniem w opcji Control Post 1.
Control Port 2 - analogicznie to opcji Control Port 1 z tym że dotyczy urządzenia sterującego w porcie 2 w C64.
Mode - wiadomo.
Są to najważniejsze opcje, w opcji Control Port, najczęściej ustawiamy opcję Joystick, gdyż większość gier grało się na joystick'u, w opcji mode mamy następujące opcję:
Pozostałe opcje:
Switch Control Ports - opcja ta zamienia sterowanie z portu 1 na port2 i odwrotnie.
Calibrate Joystick - opcja służy do kalibracji joysticka w naszym PC.
Calibrate JoyAdapter - opcja służy do kalibracji joysticka w porcie adapter w PC.
Define Joystick Keyset - opcja ta pozwala na zdefiniowanie klawiszy, jeżeli zamierzamy grać za pomocą klawiatury w naszym PC.
Define Joystick Special - umożliwia nam ustawienia specjalnych funkcji w joysticku, raczej tę opcję rzadko się używa.
Ustawienia sterowania jak widać nie są trudne w emulatorze CCS64, a joystick znane z Commodore 64 możemy zastąpić, każdym joystick'iem przeznaczonym dla komputerów PC lub gamepad'em.