Bionic Commando to gra akcji osadzona w alternatywnej rzeczywistości. Akcja toczy się w latach 80., po tym jak fikcyjne państwo o nazwie "Federation" dokonało inwazji na sąsiednie kraje i zmusiło je do poddania się.

Gracz wciela się w rolę Rad’a Spencera, który jest żołnierzem specjalnego oddziału, którego zadaniem jest uwolnić więzionego przywódcę ruchu oporu, Super Joe. Joe posiada kluczowe informacje na temat super broni, która może zakończyć wojnę. Jednak nie jest to zadanie łatwe, ponieważ gracz ma do pokonania wiele przeszkód i wrogów.

Największą nowością gry "Bionic Commando" jest fakt, że bohater nie może skakać. Zamiast tego, posiada bioniczne ramię, które może wykorzystać do poruszania się po planszy, krawędziach i do atakowania wrogów. Rad jest również uzbrojony w różne rodzaje broni, takie jak karabin maszynowy czy granaty, które pomogą mu w walkach z przeciwnikami.

Gracz podróżuje po różnych etapach gry, walkę prowadząc w różnych środowiskach, takich jak lasy, miasta, bazy wojskowe czy twierdze. Gra jest wciągająca i wymagająca, a zwycięstwo – satysfakcjonujące.