W UNCHARTED WATERS odgrywamy rolę młodego chłopca, którego rodzina jest na skraju wymarcia. Z całej szlachetnej rodziny pozostałeś tylko ty i twój ojciec. Po wspaniałym powrocie Vasco da Gamy z Portugali w 1948 roku ojciec twój jest zainspirowany do podobnej ekspedycji do Indii i przywrócenia chwały waszej rodziny. Po twoim wyjeździe do Lizbony ojciac zaczyna wyprawę, która niestety kończy się jego śmiercią na zdradzieckich wodach. Jedyny ocalały - pierwszy kapitan - i ty decydujecie się na dokończonie dzieła twojego ojca. Gra jest zdecydowanie grą handlową. Używając ostatnich pieniędzy jakie masz musisz wyposażyć statek w wodę, jedzenie i załogę oraz oczywiście towary do handlowania. Następnie wyruszamy do innych portów i sprzedajemy towary po wyższych cenach. Podczas gry zdobywasz nowe doświadczenie, które pozwoli ci na zatrudnienie nowej załogi, kupno nowych statków oraz poprawi twoje umiejętności żeglarskie. Gra w obsłudze jest bardzo prosta i nie powinna stwarzać większych problemów.